12x12 Expert Sudoku on edasijõudnud numbrimõistatus, mida mängitakse 12×12 ruudustikul umbes 36–43 algse vihjega, jättes ligikaudu 101–108 lahtrit tühjaks. Sellel tasemel on paaridest ja kolmikest vaja, kuid neist ei piisa — edasiminek nõuab kalamustreid, mida rakendatakse kaheteistkümnes reas ja kaheteistkümnes veerus. 12×12 ruudustik on suurim standardne Sudoku formaat, kus X-Wing, Swordfish ja Jellyfish konfiguratsioonid ilmnevad kõige mitmekesisemalt, sest kaksteist rida ja kaksteist veergu pakuvad kandidaadi joondamiseks rohkem võimalikke rea/veeru kombinatsioone kui ükski väiksem ruudustik. Ekspert-taseme 12×12 lahendamine on koht, kus kalamustrite meisterlikkus jõuab oma täieliku väljenduseni. Mängi tasuta Expert mõistatusi SudokuPro lehel.
12x12 Expert Sudoku nõuab mustrite äratundmist 144-lahtrilisel väljal, mille mõõtkava muudab pelga visuaalse kontrolli ebapraktiliseks.
Üle 100 tühja lahtri ja kaheteistkümne võimaliku sümboliga on Expert 12×12 mõistatuse algne kandidaadivõrk üks keerukamaid, mida pliiatsi ja paberiga Sudoku üldse pakub. Edenemist mõõdetakse süstemaatiliste läbimiste, mitte üksikute käikudega, ning iga läbimine peab enne järgmise tehnika rakendamist uuendama kõiki 36 ühikut.
Iga kaheteistkümne sümboli puhul kontrolli kõiki kahtteist rida, et leida need, kus sümbolil on täpselt kaks kandidaatlähtrit. Kui kaks sellist rida jagavad samu kahte veergu, moodustavad need X-Wing’i — eemalda sümbol kõigist teistest lahtritest nendes kahes veerus. Seejärel korda kontrolli veergude kaupa. 12×12 ruudustikul on võimalike kahe rea kombinatsioonide arv (66) peaaegu kaks korda suurem kui 9×9 puhul (36), mis tähendab, et X-Wing konfiguratsioone on märgatavalt rohkem. Süsteemne sümboli-, rea- ja veerupõhine kontroll — mitte lootus mustreid visuaalselt märgata — on sellel skaalal ainus usaldusväärne lähenemine.
Iga sümboli puhul leia kõik read, kus on täpselt kaks või kolm kandidaatlähtrit. Kontrolli, kas mõni kolm sellist rida piirab oma kandidaadid ühiselt samade kolme veeruga: kui jah, eemalda sümbol kõigist teistest lahtritest nendes kolmes veerus. Võimalike kolme rea kombinatsioonide arv 12×12 ruudustikus on 220, võrreldes 84-ga 9×9 puhul — see tähendab, et Swordfish mustreid tekib palju sagedamini, kuid nende leidmine nõuab ka distsiplineeritumat otsinguprotsessi. Kõige tõhusam tehnika on ehitada iga kahe- või kolmekandidaadiga rea jaoks veerukatvuse kaart.
Jellyfish nõuab nelja rida, mille kandidaadid mingi sümboli jaoks katavad ühiselt täpselt neli veergu. 12×12 ruudustikul on 495 võimalikku nelja rea kombinatsiooni, mis teeb Jellyfish konfiguratsioonid Expert raskusastmel märksa sagedasemaks kui 9×9 puhul. Kui Jellyfish on tuvastatud, eemaldatakse sümbol kõigist teistest lahtritest neljas täielikus veerus — sageli kogu lahenduse kõige mõjusam elimineerimisamm.
Pärast Expert taset rakendab 12x12 Extreme Sudoku kogu 12×12 skaalal XYZ-Wing’i ja Alternating Inference Chains’i — sügavaimat loogilist analüüsi, mis selles formaadis saadaval on. Kalamustrite kinnistamiseks enne edasi liikumist pakub 12x12 Hard Sudoku madalama survega keskkonda paaride ja kolmikute harjutamiseks. Kõik tasemed on saadaval 12x12 Sudoku keskuses, tehnikajuhendid lehel SudokuPro How-to-Play ning tasuta mõistatused SudokuPro avalehel.